Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc130Q9D516 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc130Q9D516 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc130Q9D516 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc130Q9D516 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc130Q9D516 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc130Q9D516 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms