Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933421I07RikQ9D420 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933421I07RikQ9D420 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933421I07RikQ9D420 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933421I07RikQ9D420 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933421I07RikQ9D420 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933421I07RikQ9D420 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933421I07RikQ9D420 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933421I07RikQ9D420 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933421I07RikQ9D420 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933421I07RikQ9D420 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933421I07RikQ9D420 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933421I07RikQ9D420 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933421I07RikQ9D420 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933421I07RikQ9D420 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933421I07RikQ9D420 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933421I07RikQ9D420 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms