Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933428M09RikQ9D3X3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933428M09RikQ9D3X3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933428M09RikQ9D3X3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933428M09RikQ9D3X3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms