Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx20Q9D2Y5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx20Q9D2Y5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx20Q9D2Y5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx20Q9D2Y5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx20Q9D2Y5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx20Q9D2Y5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx20Q9D2Y5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms