Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed11Q9D2R4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed11Q9D2R4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed11Q9D2R4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed11Q9D2R4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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