Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
9230112D13RikQ9D260 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9230112D13RikQ9D260 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
9230112D13RikQ9D260 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
9230112D13RikQ9D260 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9230112D13RikQ9D260 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
9230112D13RikQ9D260 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230112D13RikQ9D260 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms