Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MceeQ9D1I5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms