Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Upk1aQ9D132 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Upk1aQ9D132 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upk1aQ9D132 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Upk1aQ9D132 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upk1aQ9D132 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upk1aQ9D132 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upk1aQ9D132 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upk1aQ9D132 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Upk1aQ9D132 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upk1aQ9D132 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upk1aQ9D132 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upk1aQ9D132 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upk1aQ9D132 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms