Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl52Q9D0Y8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl52Q9D0Y8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl52Q9D0Y8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl52Q9D0Y8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms