Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrto4Q9D0I8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrto4Q9D0I8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrto4Q9D0I8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrto4Q9D0I8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrto4Q9D0I8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms