Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab3bQ9CZT8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab3bQ9CZT8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3bQ9CZT8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3bQ9CZT8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3bQ9CZT8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms