Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc12Q9CZA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc12Q9CZA5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc12Q9CZA5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc12Q9CZA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Zcchc12Q9CZA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc12Q9CZA5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc12Q9CZA5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc12Q9CZA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc12Q9CZA5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc12Q9CZA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms