Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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Xrcc3Q9CXE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xrcc3Q9CXE6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xrcc3Q9CXE6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Xrcc3Q9CXE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Xrcc3Q9CXE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc3Q9CXE6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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