Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot11Q9CWN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot11Q9CWN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot11Q9CWN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot11Q9CWN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot11Q9CWN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot11Q9CWN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot11Q9CWN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot11Q9CWN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot11Q9CWN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot11Q9CWN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot11Q9CWN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot11Q9CWN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms