Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BccipQ9CWI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BccipQ9CWI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BccipQ9CWI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BccipQ9CWI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BccipQ9CWI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BccipQ9CWI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BccipQ9CWI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms