Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC8

Lrrc40, Leucine-rich repeat-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc40Q9CRC8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc40Q9CRC8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc40Q9CRC8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc40Q9CRC8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc40Q9CRC8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc40Q9CRC8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc40Q9CRC8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc40Q9CRC8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc40Q9CRC8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc40Q9CRC8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc40Q9CRC8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc40Q9CRC8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc40Q9CRC8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms