Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chchd3Q9CRB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chchd3Q9CRB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chchd3Q9CRB9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chchd3Q9CRB9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chchd3Q9CRB9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chchd3Q9CRB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms