Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR34

Uncharacterized protein C5orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR34 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CR34 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CR34 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CR34 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CR34 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CR34 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CR34 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CR34 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CR34 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CR34 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CR34 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CR34 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CR34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CR34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CR34 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CR34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CR34 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CR34 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CR34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CR34 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CR34 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CR34 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CR34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CR34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CR34 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CR34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CR34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CR34 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CR34 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CR34 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CR34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CR34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CR34 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CR34 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CR34 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CR34 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CR34 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CR34 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CR34 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CR34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CR34 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CR34 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CR34 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CR34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CR34 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CR34 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CR34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CR34 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CR34 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CR34 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CR34 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CR34 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CR34 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CR34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CR34 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CR34 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CR34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CR34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CR34 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CR34 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CR34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CR34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CR34 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CR34 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CR34 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR34 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR34 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR34 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR34 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR34 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CR34 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR34 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR34 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR34 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR34 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR34 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR34 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR34 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR34 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR34 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR34 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR34 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CR34 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CR34 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CR34 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CR34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CR34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CR34 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms