Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gkn2Q9CQS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gkn2Q9CQS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gkn2Q9CQS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gkn2Q9CQS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gkn2Q9CQS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gkn2Q9CQS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkn2Q9CQS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms