Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN4

Sostdc1, Sclerostin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sostdc1Q9CQN4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sostdc1Q9CQN4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sostdc1Q9CQN4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sostdc1Q9CQN4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sostdc1Q9CQN4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sostdc1Q9CQN4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sostdc1Q9CQN4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sostdc1Q9CQN4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sostdc1Q9CQN4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sostdc1Q9CQN4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sostdc1Q9CQN4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sostdc1Q9CQN4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sostdc1Q9CQN4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sostdc1Q9CQN4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sostdc1Q9CQN4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sostdc1Q9CQN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms