Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccer1Q9CQL2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer1Q9CQL2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer1Q9CQL2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccer1Q9CQL2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccer1Q9CQL2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer1Q9CQL2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer1Q9CQL2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer1Q9CQL2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer1Q9CQL2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer1Q9CQL2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms