Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ergic3Q9CQE7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ergic3Q9CQE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ergic3Q9CQE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ergic3Q9CQE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ergic3Q9CQE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ergic3Q9CQE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ergic3Q9CQE7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ergic3Q9CQE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ergic3Q9CQE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ergic3Q9CQE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms