Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp2Q9CQ49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncbp2Q9CQ49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncbp2Q9CQ49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncbp2Q9CQ49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncbp2Q9CQ49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncbp2Q9CQ49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncbp2Q9CQ49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms