Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc18Q9CQ07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc18Q9CQ07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc18Q9CQ07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc18Q9CQ07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms