Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ska1Q9CPV1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ska1Q9CPV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ska1Q9CPV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ska1Q9CPV1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska1Q9CPV1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska1Q9CPV1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ska1Q9CPV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ska1Q9CPV1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ska1Q9CPV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms