Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim8Q99PJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim8Q99PJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim8Q99PJ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim8Q99PJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim8Q99PJ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim8Q99PJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim8Q99PJ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms