Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl4dQ99PE9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl4dQ99PE9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl4dQ99PE9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Arl4dQ99PE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl4dQ99PE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arl4dQ99PE9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arl4dQ99PE9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arl4dQ99PE9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arl4dQ99PE9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arl4dQ99PE9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms