Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1321.2 ms