Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcgf6Q99NA9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcgf6Q99NA9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcgf6Q99NA9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcgf6Q99NA9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcgf6Q99NA9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcgf6Q99NA9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pcgf6Q99NA9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pcgf6Q99NA9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pcgf6Q99NA9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pcgf6Q99NA9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcgf6Q99NA9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pcgf6Q99NA9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pcgf6Q99NA9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcgf6Q99NA9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcgf6Q99NA9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms