Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl43Q99N89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl43Q99N89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl43Q99N89 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl43Q99N89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl43Q99N89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl43Q99N89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl43Q99N89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl43Q99N89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms