Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a6dQ99N07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ms4a6dQ99N07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a6dQ99N07 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a6dQ99N07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ms4a6dQ99N07 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms