Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms