Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca3Q99M54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca3Q99M54 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca3Q99M54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca3Q99M54 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca3Q99M54 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca3Q99M54 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms