Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap3Q99LM2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap3Q99LM2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap3Q99LM2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap3Q99LM2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk5rap3Q99LM2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms