Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GatbQ99JT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GatbQ99JT1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GatbQ99JT1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GatbQ99JT1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GatbQ99JT1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms