Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef1Q99JL1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spef1Q99JL1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef1Q99JL1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef1Q99JL1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spef1Q99JL1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef1Q99JL1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms