Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgs1Q923W1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgs1Q923W1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tgs1Q923W1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tgs1Q923W1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tgs1Q923W1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tgs1Q923W1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgs1Q923W1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tgs1Q923W1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgs1Q923W1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms