Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tubb6Q922F4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tubb6Q922F4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubb6Q922F4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubb6Q922F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tubb6Q922F4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tubb6Q922F4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubb6Q922F4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms