Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med28Q920D3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med28Q920D3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med28Q920D3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med28Q920D3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms