Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps36Q91XD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps36Q91XD6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps36Q91XD6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps36Q91XD6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps36Q91XD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps36Q91XD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps36Q91XD6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms