Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac11Q91WA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac11Q91WA3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac11Q91WA3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac11Q91WA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac11Q91WA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdac11Q91WA3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms