Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps11Q91W86 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps11Q91W86 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps11Q91W86 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps11Q91W86 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps11Q91W86 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps11Q91W86 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps11Q91W86 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms