Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE5

Pcdhb10, Protocadherin beta 10, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb10Q91VE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb10Q91VE5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb10Q91VE5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb10Q91VE5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb10Q91VE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb10Q91VE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdhb10Q91VE5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb10Q91VE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb10Q91VE5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb10Q91VE5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb10Q91VE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb10Q91VE5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms