Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf130Q8VEM1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf130Q8VEM1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf130Q8VEM1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf130Q8VEM1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf130Q8VEM1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf130Q8VEM1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf130Q8VEM1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf130Q8VEM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf130Q8VEM1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf130Q8VEM1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms