Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paip1Q8VE62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paip1Q8VE62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paip1Q8VE62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paip1Q8VE62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paip1Q8VE62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Paip1Q8VE62 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paip1Q8VE62 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms