Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FggQ8VCM7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FggQ8VCM7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FggQ8VCM7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FggQ8VCM7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FggQ8VCM7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FggQ8VCM7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FggQ8VCM7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms