Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W5

Tsen15, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen15Q8R3W5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsen15Q8R3W5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen15Q8R3W5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsen15Q8R3W5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen15Q8R3W5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen15Q8R3W5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen15Q8R3W5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms