Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf1Q8R3P9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slf1Q8R3P9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf1Q8R3P9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slf1Q8R3P9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf1Q8R3P9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf1Q8R3P9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slf1Q8R3P9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf1Q8R3P9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms