Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc12Q8R344 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc12Q8R344 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc12Q8R344 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc12Q8R344 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc12Q8R344 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc12Q8R344 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc12Q8R344 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc12Q8R344 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms