Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc137Q8R0K4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc137Q8R0K4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc137Q8R0K4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc137Q8R0K4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc137Q8R0K4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc137Q8R0K4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc137Q8R0K4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc137Q8R0K4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc137Q8R0K4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc137Q8R0K4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc137Q8R0K4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc137Q8R0K4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc137Q8R0K4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc137Q8R0K4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc137Q8R0K4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms